自1987年政府開放民眾赴大陸地區探親以來，兩岸民間交流的日益頻繁，雙方經貿關係快速發展，臺商赴大陸投資日益增加。

　　隨著兩岸經貿互動日趨頻繁，臺商協會與需要服務的台商數量增加，相關服務需求日益擴大，需要服務的態樣亦呈現多樣化。為加強提供本地企業及大陸臺商更充分的兩岸經貿資訊及諮詢服務，保障臺商在大陸投資的權益，並強化與大陸地區臺商的聯繫溝通，本會「臺商服務中心」於2005年8月30日正式成立。

　　臺商是臺灣經濟實力的向外延伸，對臺灣經濟成長貢獻良多，同時臺商也是兩岸關係的重要臍帶。因此，本會歷任董事長均強調，應加強本會的臺商服務工作，作臺商堅強的後盾，強化海基會作為政府與臺商之間的溝通橋樑功能與協調整合的角色，繼續加強兩岸經貿交流，提升服務品質，並配合政府政策，協助臺商發展。

　　臺商服務中心為整合政府及民間資源，建構服務臺商的平台，強化各項服務的深度與廣度，提供包括：人身安全急難救助、經貿糾紛協處、投資經營諮詢、法律協助、即時訊息提供等服務，以維護臺商權益，提供有效援助，使海基會成為所有臺商朋友的「後頭厝」。

　　全力推動服務品質與效能是海基會重要工作與職責。尤其，目前臺商在大陸面臨經營大環境嚴峻的挑戰，臺商服務中心將透過多元管道加強提供專業經營資訊及協助臺商產業轉型升級，以滿足臺商經營事業需求，並強化經營優勢來面對國際的激烈競爭。臺商服務中心全體同仁將持續以「親切真誠」的態度，提供臺商各項即時服務與協助，並落實政府照顧臺商之美意，維護兩岸經貿交流的秩序，積極推動兩岸經貿互惠雙贏的發展。